我国台湾地区的科技管理体制形成于台湾经济起飞阶段初期，早期形成的是科技决策和政策执行相分离的体制结构。随着台湾地区行政体制的改变，经过第一次科技管理体制的改革，科技主管部门主导了台湾经济高速发展阶段的科学技术事业，在市场经济环境中形成了科学技术的“计划”发展模式和政策体系。社会和经济发展所积累的矛盾是其科技管理体制再次进行重大改革、导致科技主管部门转型为新的科技主管部门的主要原因，台湾的科技事业将走向分散管理的模式，仅靠管理体制的改革并不能解决台湾地区科技发展战略存在的问题。